Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRO2289Q9P1D8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRO2289Q9P1D8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms