Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms