Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TMOD3Q9NYL9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMOD3Q9NYL9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
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