Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAH9Q9NYC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DNAH9Q9NYC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms