Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECAP2Q9NVZ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NECAP2Q9NVZ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECAP2Q9NVZ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECAP2Q9NVZ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECAP2Q9NVZ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECAP2Q9NVZ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECAP2Q9NVZ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECAP2Q9NVZ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECAP2Q9NVZ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECAP2Q9NVZ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECAP2Q9NVZ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms