Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPS4Q9NQG7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS4Q9NQG7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms