Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC40A1Q9NP59 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC40A1Q9NP59 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC40A1Q9NP59 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms