Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRA1Q9HD15 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRA1Q9HD15 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRA1Q9HD15 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRA1Q9HD15 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRA1Q9HD15 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRA1Q9HD15 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRA1Q9HD15 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRA1Q9HD15 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SRA1Q9HD15 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRA1Q9HD15 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms