Protein–RNA interactions for Protein: Q9H944

MED20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED20Q9H944 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED20Q9H944 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MED20Q9H944 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED20Q9H944 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED20Q9H944 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED20Q9H944 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MED20Q9H944 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MED20Q9H944 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED20Q9H944 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MED20Q9H944 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED20Q9H944 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED20Q9H944 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED20Q9H944 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED20Q9H944 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED20Q9H944 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms