Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN2Q9H4D0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN2Q9H4D0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms