Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-3Q9BYQ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms