Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP85Q9BW27 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms