Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC50A1Q9BRV3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 840.4 ms