Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR8

GPATCH1, G patch domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH1Q9BRR8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPATCH1Q9BRR8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPATCH1Q9BRR8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPATCH1Q9BRR8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms