Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMSS1Q9BQ75 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMSS1Q9BQ75 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMSS1Q9BQ75 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMSS1Q9BQ75 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMSS1Q9BQ75 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMSS1Q9BQ75 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMSS1Q9BQ75 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMSS1Q9BQ75 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMSS1Q9BQ75 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMSS1Q9BQ75 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMSS1Q9BQ75 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms