Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGPAT1Q99943 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPAT1Q99943 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms