Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms