Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3YL1Q96HL8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3YL1Q96HL8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 510.2 ms