Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC34Q96HJ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.4 ms