Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGF29Q96ES7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms