Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMAQ96B86 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMAQ96B86 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGMAQ96B86 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms