Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1CQ92928 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms