Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXQ3

LINC01599, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01599, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01599Q8WXQ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01599Q8WXQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01599Q8WXQ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC01599Q8WXQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC01599Q8WXQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms