Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF31Q8WWY3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF31Q8WWY3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 431.2 ms