Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE12

LMX1A, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMX1AQ8TE12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMX1AQ8TE12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMX1AQ8TE12 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMX1AQ8TE12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms