Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAG3L4Q8TBR4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAG3L4Q8TBR4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms