Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFWD2Q8NHY2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms