Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC01

CLEC1A, C-type lectin domain family 1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1AQ8NC01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLEC1AQ8NC01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLEC1AQ8NC01 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms