Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q8N8P6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q8N8P6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q8N8P6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q8N8P6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q8N8P6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q8N8P6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q8N8P6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q8N8P6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q8N8P6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q8N8P6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q8N8P6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q8N8P6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q8N8P6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q8N8P6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q8N8P6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q8N8P6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q8N8P6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q8N8P6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q8N8P6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q8N8P6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q8N8P6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8N8P6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8N8P6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8N8P6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8N8P6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8N8P6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8N8P6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8N8P6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8N8P6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8N8P6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8N8P6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8N8P6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8N8P6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8N8P6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8N8P6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8N8P6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8N8P6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8N8P6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8N8P6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q8N8P6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q8N8P6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q8N8P6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8N8P6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8N8P6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8N8P6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8N8P6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8N8P6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8N8P6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8N8P6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8N8P6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8N8P6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8N8P6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8N8P6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8N8P6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8N8P6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8N8P6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8N8P6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8N8P6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8N8P6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8N8P6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8N8P6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8N8P6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8N8P6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8N8P6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8N8P6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms