Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAS3Q8IXF0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS3Q8IXF0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms