Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms