Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TMC4Q7Z404 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMC4Q7Z404 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMC4Q7Z404 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms