Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL13AP3Q6NVV1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms