Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.061e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.531e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PIGG-211ENST00000506402 2387 ntTSL 1 (best)11.39□□□□□ -0.591e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ASXL1-211ENST00000619344 550 ntTSL 511.38□□□□□ -0.591e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.591e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.61e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 311.27□□□□□ -0.611e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.611e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.621e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 AC005381.1-203ENST00000591920 569 ntTSL 511.13□□□□□ -0.631e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.634e-8■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 211.01□□□□□ -0.654e-8■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.661e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 GORASP2-202ENST00000442798 1976 ntTSL 210.85□□□□□ -0.671e-5■■■■□ 22.3
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