RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.3■■■■□ 3.72
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CITED2-201ENST00000367651 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
CITED2-201ENST00000367651 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
CITED2-201ENST00000367651 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.36■■■□□ 2.77
CITED2-201ENST00000367651 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.83■■■□□ 2.69
CITED2-201ENST00000367651 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.71■■■□□ 2.67
CITED2-201ENST00000367651 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.67■■■□□ 2.66
CITED2-201ENST00000367651 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.34■■■□□ 2.61
CITED2-201ENST00000367651 HRCP23327 699 aa31.28■■■□□ 2.6
CITED2-201ENST00000367651 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.07■■■□□ 2.56
CITED2-201ENST00000367651 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.85■■■□□ 2.53
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CITED2-201ENST00000367651 SCRIBQ14160 1630 aa30.52■■■□□ 2.48
CITED2-201ENST00000367651 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CITED2-201ENST00000367651 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CITED2-201ENST00000367651 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.28■■■□□ 2.44
CITED2-201ENST00000367651 TRIM41Q8WV44 630 aa30.13■■■□□ 2.41
CITED2-201ENST00000367651 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CITED2-201ENST00000367651 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.95■■■□□ 2.39
CITED2-201ENST00000367651 NACADO15069 1562 aa29.91■■■□□ 2.38
CITED2-201ENST00000367651 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.86■■■□□ 2.37
CITED2-201ENST00000367651 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.82■■■□□ 2.36
CITED2-201ENST00000367651 WIZO95785 1651 aa29.75■■■□□ 2.35
CITED2-201ENST00000367651 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
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CITED2-201ENST00000367651 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CITED2-201ENST00000367651 ABCC8Q09428 1581 aa29.22■■■□□ 2.27
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CITED2-201ENST00000367651 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.15■■■□□ 2.26
CITED2-201ENST00000367651 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CITED2-201ENST00000367651 SMARCA4P51532 1647 aa29.13■■■□□ 2.25
CITED2-201ENST00000367651 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CITED2-201ENST00000367651 SMARCA2P51531 1590 aa29.1■■■□□ 2.25
CITED2-201ENST00000367651 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.04■■■□□ 2.24
CITED2-201ENST00000367651 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CITED2-201ENST00000367651 SOGA1O94964 1423 aa28.98■■■□□ 2.23
CITED2-201ENST00000367651 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
CITED2-201ENST00000367651 CEP162Q5TB80 1403 aa28.95■■■□□ 2.23
CITED2-201ENST00000367651 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
CITED2-201ENST00000367651 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CITED2-201ENST00000367651 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.86■■■□□ 2.21
CITED2-201ENST00000367651 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.82■■■□□ 2.2
CITED2-201ENST00000367651 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.78■■■□□ 2.2
CITED2-201ENST00000367651 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.73■■■□□ 2.19
CITED2-201ENST00000367651 EEA1Q15075 1411 aa28.7■■■□□ 2.18
CITED2-201ENST00000367651 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CITED2-201ENST00000367651 NEUROD1Q13562 356 aa28.63■■■□□ 2.17
CITED2-201ENST00000367651 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CITED2-201ENST00000367651 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA3Q08378 1498 aa28.61■■■□□ 2.17
CITED2-201ENST00000367651 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CITED2-201ENST00000367651 SYNJ1O43426 1573 aa28.52■■■□□ 2.16
CITED2-201ENST00000367651 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.5■■■□□ 2.15
CITED2-201ENST00000367651 KIF21BO75037 1637 aa28.41■■■□□ 2.14
CITED2-201ENST00000367651 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.4■■■□□ 2.14
CITED2-201ENST00000367651 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.33■■■□□ 2.13
CITED2-201ENST00000367651 CLIP1P30622 1438 aa28.32■■■□□ 2.12
CITED2-201ENST00000367651 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
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CITED2-201ENST00000367651 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CITED2-201ENST00000367651 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.28■■■□□ 2.12
CITED2-201ENST00000367651 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.25■■■□□ 2.11
CITED2-201ENST00000367651 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.23■■■□□ 2.11
CITED2-201ENST00000367651 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CITED2-201ENST00000367651 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CITED2-201ENST00000367651 TOP2BQ02880 1626 aa28.07■■■□□ 2.08
CITED2-201ENST00000367651 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CITED2-201ENST00000367651 MIER1Q8N108 512 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED2-201ENST00000367651 APLP2Q06481 763 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED2-201ENST00000367651 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.96■■■□□ 2.07
CITED2-201ENST00000367651 ARAP1Q96P48 1450 aa27.89■■■□□ 2.06
CITED2-201ENST00000367651 PRXQ9BXM0 1461 aa27.88■■■□□ 2.05
CITED2-201ENST00000367651 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.86■■■□□ 2.05
CITED2-201ENST00000367651 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CITED2-201ENST00000367651 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CITED2-201ENST00000367651 CUX1P39880 1505 aa27.77■■■□□ 2.04
CITED2-201ENST00000367651 NCAPD3P42695 1498 aa27.7■■■□□ 2.03
CITED2-201ENST00000367651 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.65■■■□□ 2.02
CITED2-201ENST00000367651 HMGXB3Q12766 1538 aa27.64■■■□□ 2.02
CITED2-201ENST00000367651 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
CITED2-201ENST00000367651 KIF27Q86VH2 1401 aa27.61■■■□□ 2.01
CITED2-201ENST00000367651 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.57■■■□□ 2
CITED2-201ENST00000367651 CFTRP13569 1480 aa27.52■■■□□ 2
CITED2-201ENST00000367651 CUX2O14529 1486 aa27.52■■■□□ 2
CITED2-201ENST00000367651 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.48■■□□□ 1.99
CITED2-201ENST00000367651 ITGAEP38570 1179 aa27.41■■□□□ 1.98
CITED2-201ENST00000367651 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.38■■□□□ 1.97
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CITED2-201ENST00000367651 MAPKBP1O60336 1514 aa27.33■■□□□ 1.96
CITED2-201ENST00000367651 TIAM1Q13009 1591 aa27.32■■□□□ 1.96
CITED2-201ENST00000367651 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.31■■□□□ 1.96
CITED2-201ENST00000367651 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
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CITED2-201ENST00000367651 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.2■■□□□ 1.94
CITED2-201ENST00000367651 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.2■■□□□ 1.94
CITED2-201ENST00000367651 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.2■■□□□ 1.94
CITED2-201ENST00000367651 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.2■■□□□ 1.94
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