Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP6Q5VW22 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP6Q5VW22 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms