Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREML2Q5T2D2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TREML2Q5T2D2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREML2Q5T2D2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms