Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
WASHC2DQ5SRD0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WASHC2DQ5SRD0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms