Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEXMIFQ5QGS0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEXMIFQ5QGS0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEXMIFQ5QGS0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms