Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRRT3Q5FWE3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRRT3Q5FWE3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms