Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf21Q32NC0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf21Q32NC0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf21Q32NC0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms