Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKOR2Q2VWA4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKOR2Q2VWA4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKOR2Q2VWA4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKOR2Q2VWA4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SKOR2Q2VWA4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKOR2Q2VWA4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKOR2Q2VWA4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms