Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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