Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAT1Q14517 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT1Q14517 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT1Q14517 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms