Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CDK13Q14004 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK13Q14004 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CDK13Q14004 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
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