Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN4PQ13434 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN4PQ13434 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
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