Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MKRN3Q13064 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKRN3Q13064 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKRN3Q13064 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
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