Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRYQ05066 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRYQ05066 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRYQ05066 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRYQ05066 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRYQ05066 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRYQ05066 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRYQ05066 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRYQ05066 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRYQ05066 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRYQ05066 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRYQ05066 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRYQ05066 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRYQ05066 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRYQ05066 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRYQ05066 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRYQ05066 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRYQ05066 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRYQ05066 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRYQ05066 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRYQ05066 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRYQ05066 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRYQ05066 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRYQ05066 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRYQ05066 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRYQ05066 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRYQ05066 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRYQ05066 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRYQ05066 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRYQ05066 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRYQ05066 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRYQ05066 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRYQ05066 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRYQ05066 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRYQ05066 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRYQ05066 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRYQ05066 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRYQ05066 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRYQ05066 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRYQ05066 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRYQ05066 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRYQ05066 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRYQ05066 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRYQ05066 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRYQ05066 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms