Protein–RNA interactions for Protein: P98077

SHC2, SHC-transforming protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC2P98077 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC2P98077 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC2P98077 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC2P98077 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC2P98077 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC2P98077 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC2P98077 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC2P98077 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC2P98077 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC2P98077 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC2P98077 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC2P98077 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC2P98077 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC2P98077 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC2P98077 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC2P98077 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC2P98077 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHC2P98077 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SHC2P98077 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHC2P98077 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHC2P98077 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHC2P98077 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHC2P98077 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHC2P98077 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHC2P98077 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHC2P98077 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHC2P98077 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC2P98077 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC2P98077 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC2P98077 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC2P98077 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC2P98077 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC2P98077 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC2P98077 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC2P98077 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC2P98077 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC2P98077 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC2P98077 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC2P98077 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC2P98077 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC2P98077 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC2P98077 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC2P98077 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC2P98077 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC2P98077 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC2P98077 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC2P98077 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC2P98077 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC2P98077 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC2P98077 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC2P98077 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC2P98077 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC2P98077 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC2P98077 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC2P98077 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC2P98077 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC2P98077 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC2P98077 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC2P98077 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC2P98077 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC2P98077 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC2P98077 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC2P98077 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC2P98077 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC2P98077 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC2P98077 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC2P98077 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC2P98077 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC2P98077 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC2P98077 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC2P98077 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC2P98077 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC2P98077 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC2P98077 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC2P98077 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC2P98077 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC2P98077 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC2P98077 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC2P98077 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC2P98077 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC2P98077 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms