Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23AP54725 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms